Najlepiej wybrać się na Borneo od marca do października, kiedy to na wyspie jest pora sucha. Jest to najlepszy czas, aby zobaczyć orangutany w środowisku naturalnym, a żółwie można zobaczyć na Lankayan wyspie między czerwcem a wrześniem.

Na wyspie panuje klimat równikowy, wybitnie wilgotny. Średnie temperatury wahają się w granicach od 27 ° C do 32 ° C i wilgotności zwykle na poziomie około 80%.